第16届大学生电影节颁奖礼于2009年4月26日晚在北京奥体中心体育馆举行，奖项逐一揭晓，获奖名单如下：

• 最佳影片奖 《梅兰芳》
• 最佳导演奖 章家瑞(《红河》)
• 评委会大奖 《非诚勿扰》
• 组委会大奖 《超强台风》《邓稼先》《喊过岭的故事》
• 最佳男演员奖 甄子丹(《叶问》)  
• 最佳女演员奖 周迅(《李米的猜想》)
• 最受欢迎男演员 范伟(《即日启程》)
• 最受欢迎女演员 张静初(《红河》)
• 最佳电视电影女演员奖 张丹妮
• 最佳观赏效果奖 《画皮》
• 最佳处女作奖 刘江(《即日启程》)
• 最佳新人奖 余少群(《梅兰芳》)
• 艺术探索奖 《秘密访问》
• 军事题材创作奖 《霓虹灯下新哨兵》
• 动画片特别奖 《风云诀》
• 教育题材创作奖 《新生万喜》《夏天有风吹过》
• 最受欢迎导演 叶伟信(《叶问》)
• 最佳电视电影男演员奖 李心敏
• 最佳电视电影导演奖 李灌洪(《走四方》)
• 最佳电视电影奖 《谁动了我的幸福》